一种流式细胞数据自动处理方法及装置与流程-k8凯发

本发明属于细胞数据处理，具体涉及一种流式细胞数据自动处理方法及装置。

背景技术：

1、在医学研究过程中，对细胞的研究和处理分析是非常重要的一个环节，一般是通过流式细胞仪针对流式细胞进行采集得到流式细胞数据，该流式细胞数据可以看作是离散数据点，每个数据点对应一个细胞，然后对该数据进行分析。

2、现有技术中对于流式细胞数据的常规分析是应用统计学方法和领域专业知识，通过人工手动圈门选定特定细胞群体进行定性或者定量分析，但是人工选定存在主观误差以及效率低下，并且流式细胞数据通常为高维度和具备复杂结构，对人工要求较高。

3、因此，如何快速准确地对流式细胞数据进行处理，避免对人工的依赖，是本领域技术人员有待解决的技术问题。

技术实现思路

1、本发明的目的是为了解决现有技术中对流式细胞数据进行分析处理时较为依赖于人工、效率低下的技术问题。

2、为实现上述技术目的，一方面，本发明提供了一种流式细胞数据自动处理方法，该方法包括：

3、获取待处理数据，同时配置需求，所述需求至少包括目标细胞群体特征和需求项公式；

4、将所述待处理数据经过预处理后得到第一数据，并根据所述目标细胞群体特征对所述第一数据进行分群并构建分群结构树；

5、根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体；

6、根据需求项公式在所述最佳细胞群体中确定出需要的运算参数，并根据所述运算参数和需求项公式确定需求项的值。

7、进一步地，所述预处理具体包括依次进行的数据清洗和降维处理。

8、进一步地，所述数据清洗具体包括：

9、为不同的数据通道设定对应的通道阈值；

10、基于所述通道阈值对所述待处理数据进行过滤得到过滤数据；

11、在所述过滤数据中确定出离群点，并将所有离群点进行删除得到筛选数据；

12、将所述筛选数据进行对数转换得到清洗完成数据。

13、进一步地，所述降维处理具体包括：

14、将所述清洗完成数据进行标准化处理得到标准化数据，所述标准化处理具体为标准分数处理；

15、基于所述标准化数据和预设系数构建每两个特征之间的相关系数矩阵；

16、根据所述相关系数矩阵确定出相关系数矩阵的特征值以及特征向量；

17、将各相关系数矩阵按照对应特征值从大到小的顺序进行排序；

18、将排序中预设名次的特征值对应的特征向量组合成特征向量矩阵，并将所述特征向量矩阵和所述清洗完成数据相乘得到所述第一数据。

19、进一步地，所述将所述第一数据进行分群并构建分群结构树，具体包括：

20、初始化结构树；

21、将所述第一数据按照预设尺寸、预设特征以及基于每个像素点统计的细胞粒子数量构建二维密度分布图像，其中，所述二维密度分布图像中通过灰度值映射密度值；

22、确定出所述二维密度分布图像的最大灰度值和最小灰度值；

23、基于所述最大灰度值、最小灰度值和预设步长对所述密度分布图进行阈值分割，并获取分割后的所有连通区域集合以及初始化结构树中所有叶子节点对应的区域集合；

24、基于所有连通区域集合和所有区域集合确定每一个连通区域集合的属性，所述属性具体包括所述叶子节点的子区域和根节点，并根据所述连通区域集合的属性将所述连通区域集合添加至所述初始化结构树中得到分群结构树。

25、进一步地，所述根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体，具体为通过如下公式进行确定：

26、，

27、，

28、式中，为g中第i个群体对象和目标细胞群体特征对应的目标细胞群体之间的距离，m为所述目标细胞群体特征的特征数量，为g中第i个群体对象的第j个特征的特征值，为所述目标细胞群体特征中的第j个特征的特征值，g为所述分群结构树的细胞群体集合，为g中与目标细胞群体差异最小的群体对象也即最佳细胞群体，为g中第i个群体对象。

29、进一步地，所述需求项公式具体为：为根据目标细胞进行计算得到需求结果而预先设立的公式。

30、进一步地，所述需求还包括执行项目、待处理数据编号和待处理数据名称，所述方法还包括将所述执行项目、待处理数据编号和待处理数据名称和所述需求项的值汇总为报告并进行保存

31、另一方面，本发明还提供了一种流式细胞数据自动处理装置，所述装置包括：

32、配置模块，用于获取待处理数据，同时配置需求，所述需求至少包括目标细胞群体特征和需求项公式；

33、预处理模块，用于将所述待处理数据经过预处理后得到第一数据，并根据所述目标细胞群体特征对所述第一数据进行分群并构建分群结构树；

34、筛选模块，用于根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体；

35、确定模块，用于根据需求项公式在所述最佳细胞群体中确定出需要的运算参数，并根据所述运算参数和需求项公式确定需求项的值。

36、本发明提供的一种流式细胞数据自动处理方法及装置，与现有技术相比，本方法先获取待处理数据，同时配置需求，所述需求至少包括目标细胞群体特征和需求项公式；然后将所述待处理数据经过预处理后得到第一数据，并根据所述目标细胞群体特征对所述第一数据进行分群并构建分群结构树；接着根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体；最后根据需求项公式在所述最佳细胞群体中确定出需要的参数，并根据所述运算参数和需求项公式确定需求项的值，实现了快速准确地对流式细胞数据进行处理，极大的避免了对人工的依赖，提升了处理流式细胞数据的效率。

37、另外，本发明还提供配置需求的步骤，可灵活配置待解析的细胞数据以及需求项，可直接添加或者修改需要得到的结果，无需针对不同分析项目开发新的分析系统，且不需要对分析过程或者特征识别过程进行硬编码，能够最大限度复用代码，降低了处理成本。

技术特征：

1.一种流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述方法包括：

2.如权利要求1所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述预处理具体包括依次进行的数据清洗和降维处理。

3.如权利要求2所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述数据清洗具体包括：

4.如权利要求3所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述降维处理具体包括：

5.如权利要求4所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述将所述第一数据进行分群并构建分群结构树，具体包括：

6.如权利要求5所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体，具体为通过如下公式进行确定：

7.如权利要求1所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述需求项公式具体为：为根据目标细胞进行计算得到需求结果而预先设立的公式。

8.如权利要求1所述的流式细胞数据自动处理方法，其特征在于，所述需求还包括执行项目、待处理数据编号和待处理数据名称，所述方法还包括将所述执行项目、待处理数据编号和待处理数据名称和所述需求项的值汇总为报告并进行保存。

9.一种流式细胞数据自动处理装置，其特征在于，所述装置包括：

技术总结
本发明公开了一种流式细胞数据自动处理方法及装置，该方法包括：先获取待处理数据，同时配置需求，所述需求至少包括目标细胞群体特征和需求项公式；然后将所述待处理数据经过预处理后得到第一数据，并根据所述目标细胞群体特征对所述第一数据进行分群并构建分群结构树；接着根据所述目标细胞群体特征在所述分群结构树中筛选出最佳细胞群体；最后根据需求项公式在所述最佳细胞群体中确定出需要的参数，并根据所述运算参数和需求项公式确定需求项的值，实现了快速准确地对流式细胞数据进行处理，极大的避免了对人工的依赖，提升了处理流式细胞数据的效率。

技术研发人员：晏波,石航
受保护的技术使用者：成都棱镜泰克生物科技有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/2/8